Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VCPP55072 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VCPP55072 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VCPP55072 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VCPP55072 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCPP55072 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCPP55072 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VCPP55072 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCPP55072 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPP55072 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPP55072 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPP55072 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPP55072 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCPP55072 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCPP55072 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCPP55072 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCPP55072 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCPP55072 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms