Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CACNB3P54284 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CACNB3P54284 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms