Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATXN1P54253 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATXN1P54253 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATXN1P54253 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms