Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COPAP53621 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPAP53621 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPAP53621 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPAP53621 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPAP53621 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPAP53621 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPAP53621 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms