Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARFIP2P53365 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFIP2P53365 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms