Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA4P52798 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA4P52798 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms