Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HK3P52790 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HK3P52790 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HK3P52790 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HK3P52790 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HK3P52790 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HK3P52790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HK3P52790 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HK3P52790 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HK3P52790 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HK3P52790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HK3P52790 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms