Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2A1P52655 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1P52655 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms