Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN3P51790 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN3P51790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms