Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITPNBP48739 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNBP48739 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms