Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCT5P48643 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCT5P48643 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT5P48643 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCT5P48643 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCT5P48643 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCT5P48643 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT5P48643 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT5P48643 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT5P48643 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT5P48643 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCT5P48643 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCT5P48643 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT5P48643 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCT5P48643 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms