Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCLMP48507 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCLMP48507 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCLMP48507 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCLMP48507 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCLMP48507 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCLMP48507 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCLMP48507 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCLMP48507 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms