Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP5P45974 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP5P45974 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP5P45974 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP5P45974 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP5P45974 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP5P45974 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP5P45974 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP5P45974 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP5P45974 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP5P45974 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms