Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL35P42766 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL35P42766 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL35P42766 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL35P42766 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL35P42766 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL35P42766 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL35P42766 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms