Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRIA2P42262 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIA2P42262 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms