Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFSF9P41273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFSF9P41273 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms