Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VHLP40337 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VHLP40337 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VHLP40337 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
VHLP40337 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
VHLP40337 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VHLP40337 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VHLP40337 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VHLP40337 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VHLP40337 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms