Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGCXP38435 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGCXP38435 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GGCXP38435 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGCXP38435 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGCXP38435 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGCXP38435 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGCXP38435 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms