Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
ZEB1P37275 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZEB1P37275 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZEB1P37275 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZEB1P37275 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms