Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SREBF1P36956 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF1P36956 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF1P36956 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms