Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TGFBR1P36897 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TGFBR1P36897 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms