Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL4P36578 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL4P36578 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL4P36578 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms