Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYH11P35749 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYH11P35749 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYH11P35749 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYH11P35749 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MYH11P35749 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYH11P35749 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYH11P35749 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYH11P35749 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYH11P35749 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYH11P35749 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYH11P35749 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYH11P35749 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms