Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX11P35716 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX11P35716 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX11P35716 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX11P35716 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX11P35716 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX11P35716 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX11P35716 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX11P35716 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX11P35716 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX11P35716 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX11P35716 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX11P35716 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX11P35716 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX11P35716 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms