Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCK1P35558 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCK1P35558 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCK1P35558 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCK1P35558 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCK1P35558 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCK1P35558 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCK1P35558 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms