Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXD12P35452 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD12P35452 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms