Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDXP35241 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDXP35241 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RDXP35241 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDXP35241 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDXP35241 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDXP35241 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDXP35241 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDXP35241 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDXP35241 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDXP35241 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDXP35241 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDXP35241 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDXP35241 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDXP35241 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms