Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RYKP34925 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RYKP34925 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RYKP34925 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RYKP34925 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RYKP34925 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RYKP34925 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RYKP34925 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RYKP34925 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RYKP34925 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RYKP34925 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RYKP34925 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms