Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	YTM1	YOR272W	1383 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SOF1	YLL011W	1470 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RIA1	YNL163C	3333 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PRM2	YIL037C	1971 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	TCM62	YBR044C	1719 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YIL152W	YIL152W	708 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	TPP1	YMR156C	717 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ASI2	YNL159C	870 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YBR134W	YBR134W	402 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	TRF5	YNL299W	1929 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SSH1	YBR283C	1473 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	USA1	YML029W	2517 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	EMP47	YFL048C	1338 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PHO12	YHR215W	1404 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PHO11	YAR071W	1404 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	KRE5	YOR336W	4098 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SOL4	YGR248W	768 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	HIS5	YIL116W	1158 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	GMH1	YKR030W	822 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YKR047W	YKR047W	306 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YNR061C	YNR061C	660 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RPS19A	YOL121C	435 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	BSD2	YBR290W	966 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SLM5	YCR024C	1479 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ALG9	YNL219C	1668 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YBR225W	YBR225W	2703 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SVF1	YDR346C	1446 nt		3.19	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	STV1	YMR054W	2673 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YDR282C	YDR282C	1245 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MOB2	YFL034C-B	864 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YGR015C	YGR015C	987 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PRE9	YGR135W	777 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	DPH1	YIL103W	1278 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	AIM22	YJL046W	1230 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RPS31	YLR167W	459 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RAD54	YGL163C	2697 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	TCB3	YML072C	4638 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	CDC9	YDL164C	2268 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	BCH2	YKR027W	2298 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	IOC4	YMR044W	1428 nt		3.18	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	BUD5	YCR038C	1929 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	snR7-L	snR7-L	214 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PFA5	YDR459C	1125 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	OTU1	YFL044C	906 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MTM1	YGR257C	1101 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SGN1	YIR001C	753 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PIR3	YKL163W	978 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MMM1	YLL006W	1281 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YLL017W	YLL017W	312 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	FRM2	YCL026C-A	582 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	APM1	YPL259C	1428 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	CNA1	YLR433C	1662 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	BIK1	YCL029C	1323 nt		3.17	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MCD4	YKL165C	2760 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	TAF8	YML114C	1533 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	NUS1	YDL193W	1128 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	COS7	YDL248W	1152 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	NBP2	YDR162C	711 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	SLX8	YER116C	825 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ERV14	YGL054C	417 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MMS2	YGL087C	414 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	COS5	YJR161C	1152 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	YLR428C	YLR428C	345 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	VPS71	YML041C	843 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ASC1	YMR116C	960 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	RAD17	YOR368W	1206 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ARO7	YPR060C	771 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MET16	YPR167C	786 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.16	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PTR3	YFR029W	2037 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	ARX1	YDR101C	1782 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	NGL3	YML118W	1518 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	PPQ1	YPL179W	1650 nt		3.15	□□□□□ -1.9
VMA11	P32842	MAG1	YER142C	891 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YKR075C	YKR075C	924 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	YBR056W-A	YBR056W-A	201 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	CMR3	YPR013C	954 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ANT1	YPR128C	987 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ALR2	YFL050C	2577 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	TAF6	YGL112C	1551 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RNA14	YMR061W	2034 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ALG11	YNL048W	1647 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	DHR2	YKL078W	2208 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	BOI2	YER114C	3123 nt		3.15	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	ROD1	YOR018W	2514 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	LOS1	YKL205W	3303 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	DIN7	YDR263C	1293 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	GEP4	YHR100C	558 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	IDP2	YLR174W	1239 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RNA1	YMR235C	1224 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RPL18B	YNL301C	561 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	MCM7	YBR202W	2538 nt		3.14	□□□□□ -1.91
VMA11	P32842	SEG1	YMR086W	2883 nt		3.14	□□□□□ -1.91

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