Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
L1CAMP32004 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
L1CAMP32004 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms