Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA11P31270 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA11P31270 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA11P31270 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms