Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB6P28072 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB6P28072 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms