Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHMLP26374 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHMLP26374 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHMLP26374 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHMLP26374 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHMLP26374 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHMLP26374 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms