Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LAMA1P25391 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LAMA1P25391 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms