Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTAFRP25105 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTAFRP25105 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms