Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE1P24864 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNE1P24864 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNE1P24864 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms