Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RRM1P23921 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RRM1P23921 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RRM1P23921 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RRM1P23921 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms