Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PRKACBP22694 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRKACBP22694 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms