Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCP2P22307 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCP2P22307 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCP2P22307 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCP2P22307 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCP2P22307 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCP2P22307 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCP2P22307 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCP2P22307 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCP2P22307 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCP2P22307 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms