Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BCKDHBP21953 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCKDHBP21953 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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