Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BGNP21810 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BGNP21810 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BGNP21810 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BGNP21810 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BGNP21810 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BGNP21810 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BGNP21810 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BGNP21810 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BGNP21810 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms