Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASTP20810 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASTP20810 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CASTP20810 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASTP20810 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CASTP20810 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASTP20810 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASTP20810 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASTP20810 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASTP20810 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASTP20810 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASTP20810 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASTP20810 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASTP20810 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASTP20810 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms