Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMNB1P20700 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMNB1P20700 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms