Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCLP19338 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCLP19338 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCLP19338 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCLP19338 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCLP19338 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCLP19338 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCLP19338 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NCLP19338 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCLP19338 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCLP19338 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCLP19338 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCLP19338 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCLP19338 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms