Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB6P18564 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGB6P18564 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms