Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCLP18206 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCLP18206 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCLP18206 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCLP18206 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCLP18206 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCLP18206 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCLP18206 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCLP18206 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms