Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRNB2P17787 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHRNB2P17787 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms