Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GAP43P17677 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GAP43P17677 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GAP43P17677 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GAP43P17677 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GAP43P17677 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GAP43P17677 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GAP43P17677 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GAP43P17677 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms