Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN2P17655 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms