Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTRB1P17538 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTRB1P17538 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms